Первые сложные клетки содержали гены сложной смеси видов.

Учёные проанализировали геном последнего общего предка эукариот и обнаружили, что его клетки уже имели сложные белковые пути, лизосомы и пероксисомы, но не имели генов, контролирующих деление. Около трети их генов не имеют аналогов у других организмов, остальные происходят от архей Асгарда, альфапротеобактерий, а также в равной степени от планктомицетов и миксококков; вклад гигантских вирусов оказался выше, чем у любой отдельной бактериальной группы. Появление этих генов происходило в несколько этапов: сначала от архей, затем от бактериальной линии до появления митохондрий, и позже от другой бактериальной группы. Результаты поддерживают модель эукариотов, возникших в микробном мата, где происходило активное горизонтальное генетическое обмен.